从序列设计到代谢通路优化,一站式科研工作台

覆盖表达模块设计、代谢通路设计、多基因组装、基因挖掘等,32 项科研工具支撑合成生物学研究全流程。

收录 30 株底盘基因组、491 条金标准代谢通路、14 套宿主密码子表

科研工具

全部工具

从设计到验证

01

设计

设计代谢通路、启动子与引物,规划基因编辑方案。

02

组装

多基因组装与载体构建,校验质粒与酶切克隆方案。

03

表达

设计表达模块,分析蛋白可溶性、信号肽与结构。

04

验证

生成湿实验方案,对比通路、检索底盘、预测互作。

30株
底盘基因组
491条
金标准代谢通路
14套
宿主密码子表

研究进展

查看全部
根分泌亮氨酸介导枯草芽孢杆菌增强烟草抗根腐病

根分泌亮氨酸介导枯草芽孢杆菌增强烟草抗根腐病

烟草根腐病由镰刀菌等土传病原真菌引起,化学防治残留问题突出,而生防菌田间定殖不稳、防效波动大。本研究从烟草根际分离筛选到一株拮抗性枯草芽孢杆菌HJ1-29,通过分裂根水培体系收集接种与未接种植株根系分泌物,用非靶向代谢组学锁定接种后显著上调的亮氨酸,并验证其作为"益生元"促进菌株趋化、生物膜形成与根际定殖,最终在盆栽试验中获得97.8%的防效。研究为"功能合生元"调控植物—微生物互作提供了可操作的

2026-10-27
  • 枯草芽孢杆菌34a通过挥发性信号与脂肽拮抗控制咖啡真菌病原

    咖啡产业长期受镰刀菌等真菌病原及霉菌毒素污染困扰。本研究从健康咖啡植株中分离出枯草芽孢杆菌34a,先通过全基因组测序与基因组挖掘预测其抗真菌潜力,再用低温等离子体质谱(LTP-MS)与直接进样电喷雾质谱(DLI-ESI-MS)分别追踪挥发性与可扩散代谢物在八组细菌—真菌对峙中的动态变化。结果显示,34a对真菌的径向生长抑制率介于15.2%–54.1%,共培养可下调 beauvericin、fumo

    2026-10-27
  • 黑曲霉粗酶与商业纯酶脱墨性能的纸种依赖性比较

    废纸回收是缓解造纸原料压力与生态负荷的可行路径,但化学脱墨能耗高、污染重。本研究从感染菠萝皮上分离一株黑曲霉,经形态学与18S rRNA测序鉴定后优化产酶条件,使纤维素酶活从1.14 U/mL提升至4.5 U/mL;随后以粗酶、商业纯酶与化学法对复印纸、手写纸、新闻纸进行脱墨对比,用脱墨效率、ISO白度、抗张指数及SEM、FTIR、XRD评价纤维结构变化。结果显示脱墨性能随纸种而变:粗酶对复印纸最

    2026-10-27
  • 基于比较转录组解析酿酒酵母低温生长相关通路与遗传靶点

    低温发酵在食品工业中可降低能耗、改善风味,但工业酿酒酵母的低温生长性能普遍不佳。本研究对186株酵母进行大规模表型筛选,获得1株耐冷菌株W6与2株独立冷敏菌株W98、W107,通过10 °C与30 °C比较转录组分析揭示耐冷与冷敏的转录特征差异,并经基因敲除验证GRE1、PMA2等8个核心候选基因的功能,为工业低温发酵酵母的理性改造提供了模块化框架与候选靶点。

    2026-10-27
  • 从乌苏烷型皂苷糖基化路线解析到酵母中伪人参皂苷RT1的从头

    伪人参皂苷RT1是竹节参中一种稀有的乌苏烷型(OA型)皂苷,天然丰度低、提取困难,制约了其开发应用。本研究以β-香树脂醇合酶PjbAS1/PjbAS2为诱饵基因开展共表达分析,从竹节参中锁定并功能鉴定了UDP-木糖基转移酶PjUGT67,证实其催化竹节参皂苷IVa木糖基化生成RT1;同时验证PjCSLM与PjC28UGT分别催化齐墩果酸→CE、CE→IVa,从而串联出OA→CE→IVa→RT1的完

    2026-10-27
  • 枯草芽孢杆菌MenA异源表达及维生素K2合成功能

    甲萘醌-7(MK-7)是维生素K2的生物活性形式,微生物发酵是其主流生产方式,但关键膜结合酶的结构与功能认识不足制约了产量提升。本研究将枯草芽孢杆菌纳豆亚种的1,4-二羟基-2-萘甲酸异戊烯基转移酶(MenA)在大肠杆菌中异源表达,通过生物信息学、EGFP融合荧光定位、表达条件优化与定点突变,确认了其膜定位特征与两个富天冬氨酸基序中7个关键残基的功能必要性,野生型BsMenA表达使MK-7产量较对

    2026-10-26
  • 铁球强化液滴生成结合深度学习

    传统细菌检测依赖精密芯片与复杂微流控,液滴均一度要求苛刻,荧光信号分析效率低、准确性不足。这项研究用铁球辅助涡旋乳化替代芯片式液滴生成,再以YOLOv11深度学习模型自动识别液滴荧光图像,结合荧光强度与液滴面积双参数叠加模型,在45分钟内完成鼠伤寒沙门氏菌检测,检出限达4.2 CFU/mL,线性范围10¹–10⁵ CFU/mL。方法学上"去芯片化"与"AI读图"两条线索合并,值得一看。

    2026-10-26

实验教程

查看全部
  • 细胞复苏存活率低冻存液渗透压

    复苏一支细胞,台盼蓝一染,死了一大半。这大概是分子生物学实验室里最让人无语的场景之一。细胞冻存柜里躺得好好的,拿出来一解冻就不行了,很多人第一反应是“冻存管没拧紧”或者“液氮罐漏气了”。真凶往往藏在冻存液的渗透压里。DMSO 本身渗透压极高,10% 的冻存液渗透压轻松破 1400 mOsm/kg,细胞在冻存时脱水、复苏时吸水,稍有不慎就直接涨破。这篇教程按操作流程拆开讲,从低级错误到进阶疑难,给你

    2026-10-27
  • qPCR熔解曲线多峰退火温度优化

    熔解曲线跑出双峰,Ct值还挺漂亮——这种“看着能过、其实不能发”的数据最折磨人。多数人第一反应是把退火温度往上抬2℃,抬完发现峰还在,只是Ct晚了。问题不在温度本身,而在你没找对是哪一步出了问题。这篇按“低级错误→分维度系统排查→进阶疑难”三层拆开讲,重点落在退火温度梯度的实操设置和判读上,附具体温度、浓度、时间参数,照着做能定位到具体环节。

    2026-10-27
  • 细胞转染毒性大培养基更换时机

    转染后细胞圆缩、漂浮、贴壁差,很多人第一反应是赶紧换液,结果越换越糟。毒性大不是单一原因,换液时机只是其中一环。这篇按“先排低级错、再按流程拆、收尾看疑难”的顺序,把脂质体/PEI转染后4-6小时换液窗口、DNA与试剂配比、血清抗生素、细胞状态和验证方法讲透。你照着做,能判断是该提前换、延后换,还是根本不该换。

    2026-10-27
  • 发酵染菌噬菌体爆发无菌操作排查

    发酵到一半,OD600从8掉到2,溶氧曲线陡然上翘,罐里泡沫翻起来——这画面做过发酵的人都懂。染菌不可怕,怕的是你按常规杂菌的思路去查,查了三天还是复发性污染。噬菌体爆发和普通染菌的处置逻辑完全不同。这篇从操作细节到设备死角,把无菌操作的排查路径拆成可执行的步骤,每一步都告诉你现象、怎么验证、怎么解决。

    2026-10-27
  • 细胞划痕实验愈合过快血清浓度降低

    划痕做出来6小时闭合一半,24小时全平,处理组和对照组长得一模一样——这是咨询里最高频的一类。审稿人一句“无法区分增殖与迁移”就能把整段数据否掉。问题大概率不在你的药,而在血清。这篇从培养基配方、细胞状态、划痕操作到时间点设置,把“愈合过快、降血清也压不住”的排查路径一次讲完,附可直接照抄的参数。

    2026-10-27
  • 蛋白纯化内毒素残留去除层析介质

    做蛋白纯化,尤其是大肠杆菌表达的重组蛋白,最让人头疼的不是收率低——是内毒素死活降不下去。药典要求注射级蛋白内毒素<5 EU/kg体重,你手头样品测出来动辄几百EU/mL,LAL试剂盒都快用完了。别急着换介质,也先别怀疑人生。这篇教程按实验流程拆解,从低级错误到进阶疑难,给你一条能落地的排查路径。覆盖样品前处理、介质选择、层析条件、再生保存全链条,每步给参数、给验证方法。

    2026-10-27

关于 DNA Lab Space

DNA Lab Space 是面向合成生物学与分子生物学研究的在线科研工具平台,提供从序列设计、工具分析到文献综述的全流程支持。平台覆盖基因设计、代谢通路设计、引物设计、蛋白优化、文献检索与论文处理等核心能力,帮助研究者快速完成从序列到方案的构建与验证。

平台按研究场景组织工具:AI 科研工具(代谢通路设计、蛋白智能分析、蛋白结构可视化),轻量化工具(引物设计、质粒图谱、CRISPR 设计等即开即用的计算工具),文献处理工具(论文撰写、降重、润色、查重、PPT 生成)。其中,酶与基因类工具涵盖 ORF 扫描、多序列比对、酶切位点分析、启动子设计、信号肽预测等;载体与引物类工具涵盖质粒图谱绘制、引物设计、融合 PCR 引物等,全部免费在线使用。

除计算工具外,平台还提供文献检索与研究进展、实验教程内容栏目。通路设计结果经过智能引擎生成、领域规则校验、底盘基因数据库比对三层保障,并标注「已通过领域规则校验」或「未经自动校验请人工复核」;生成方案为设计建议,正式实验前建议结合文献与实验室条件人工复核。